E' successo nella serata del 21/02/2002 un grave incidente appena prima della stazione internazionale di Chiasso. Un merci proveniente da Milano è deragliato sganciandosi dai carri ed andando ad urtare contro una locomotiva che procedeva in senso contrario. I carri merci staccatisi dal locomotore (E636.022) sono finiti contro una palazzina. Hanno perso la vita i due macchinisti, e tre ferrovieri svizzeri sono rimasti feriti. E' stato forse il difettoso funzionamento di uno scambio, oppure soltanto il mancato rispetto di un segnale, a causare l'incidente, ma si sa comunque che il treno stava procedendo a velocità sostenuta. Intanto la tratta da Como a Chiasso è senza linea elettrica, e gli unici treni a circolare da Como San Giovanni a Chiasso sono gli Intercity e i Cisalpini trainati da locomotori diesel da manovra sia FS che FFS.